size | 33017 |
size_real | 33017 |
ecount | 774565 |
supercluster | 6 |
annotations_summary | 11.79% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatII:Ty3-RT 8.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatII:Ty3-aRH 5.42% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatII:Ty3-RH 4.08% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatII:Ty3-GAG 3.87% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatII:Ty3-PROT 0.76% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Athila:Ty3-GAG 0.58% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatII:Ty3-INT 0.57% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Athila:Ty3-INT 0.26% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-RT 0.22% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-aRH 0.19% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Reina:Ty3-RH 0.12% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-GAG 0.08% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatIII:Ty3-RT 0.05% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/CRM:Ty3-RH 0.05% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatIV_Ogre:Ty3-aRH 0.05% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Athila:Ty3-RT 0.05% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatIV_Ogre:Ty3-RT 0.04% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Chlamyvir:Ty3-RT 0.03% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatIV_Ogre:Ty3-GAG 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/CRM:Ty3-RT 0.01% organelle/mitochondria 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Galadriel:Ty3-RT 0.00% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatIV_Ogre:Ty3-RH 0.00% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Athila:Ty3-PROT 0.00% Class_I/pararetrovirus:PARA-RT 0.00% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-RH |
pair_completeness | 0.851143754204979 |
pbs_score | None |
TR_score | None |
TR_monomer_length | None |
loop_index | 0.000212011993821365 |
satellite_probability | 9.43324980190488e-24 |
consensus | None |
TAREAN_annotation | Other |
orientation_score | 1 |
protein domains:
|
|
||||||||||||||||||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|