| size | 29722 |
| size_real | 29722 |
| ecount | 1184878 |
| supercluster | 4 |
| annotations_summary | 13.84% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Athila:Ty3-GAG 6.85% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Athila:Ty3-PROT 0.00% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-RH |
| pair_completeness | 0.788004571978584 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00450844492295269 |
| satellite_probability | 3.20953330666128e-23 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
protein domains:
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CL18 ----> CL22
No. of shared pairs: :755
CL18 ----> CL28
No. of shared pairs: :545
CL18 ----> CL160
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CL18 ----> CL17
No. of shared pairs: :24
CL18 ----> CL31
No. of shared pairs: :24
CL18 ----> CL16
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CL18 ----> CL14
No. of shared pairs: :14
CL18 ----> CL29
No. of shared pairs: :14
CL18 ----> CL4
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CL18 ----> CL6
No. of shared pairs: :12
CL18 ----> CL19
No. of shared pairs: :12
CL18 ----> CL63
No. of shared pairs: :12
CL18 ----> CL102
No. of shared pairs: :12
CL18 ----> CL130
No. of shared pairs: :12
CL18 ----> CL9
No. of shared pairs: :11
CL18 ----> CL33
No. of shared pairs: :11
CL18 ----> CL48
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CL18 ----> CL85
No. of shared pairs: :11