Cluster no. 22

Go back to cluster table

Cluster is part of supercluster: 4

Cluster characteristics:

size 28067
size_real 28067
ecount 1674241
supercluster 4
annotations_summary
pair_completeness 0.683683263347331
pbs_score None
TR_score None
TR_monomer_length None
loop_index 0.099554605380367
satellite_probability 6.20091989519976e-17
consensus None
TAREAN_annotation Other
orientation_score 0.999999402722629

protein domains:

No protein domains detected

protein domains:


Reads annotation summary

No similarity hits to repeat databases found

clusters with similarity:

Cluster Number of similarity hits
18 2340
59 1510
16 755
148 201
11 7
191 4
541 2
5 1
6 1
15 1
20 1
30 1
40 1
65 1
66 1
76 1
91 1
102 1
103 1
104 1
140 1
618 1
649 1

clusters connected through mates:

Cluster Number of shared
read pairs
k
16 951 0.187
18 755 0.172
59 473 0.128
148 212 0.058
191 62 0.0174
618 32 0.012
541 21 0.00787
31 19 0.00252
2 16 0.00198
17 16 0.00193
20 16 0.00268
4 15 0.00251
12 15 0.00227
28 14 0.00349
45 14 0.00268
66 14 0.00261
3 13 0.00211
15 13 0.00264
24 13 0.00232
44 13 0.00234
649 13 0.00489
7 11 0.00156
9 11 0.00212
23 11 0.00224
40 11 0.0018
47 11 0.00218
102 11 0.00224
1 10 0.00165
43 10 0.00194
11 9 0.00148
21 9 0.00184
26 9 0.00194
25 8 0.00182
33 8 0.00205
38 8 0.00211
48 8 0.00138
63 8 0.00144
85 8 0.00204
113 8 0.00206
5 7 0.00168
30 7 0.00114
37 7 0.00124
62 7 0.00134
70 7 0.00202
71 7 0.00145
72 7 0.00181
93 7 0.00207
163 7 0.0018
6 6 0.000948
8 6 0.00144
27 6 0.00153
34 6 0.00122
84 6 0.00145
86 6 0.00119
91 6 0.00182
98 6 0.00172
99 6 0.00182
123 6 0.00165
130 6 0.0013
145 6 0.00149
153 6 0.00154
10 5 0.00126
13 5 0.00123
14 5 0.000848
35 5 0.000866
49 5 0.00117
57 5 0.00138
58 5 0.00145
76 5 0.00127
87 5 0.00128
92 5 0.00155
103 5 0.00109
105 5 0.00123
132 5 0.00149
134 5 0.0013
151 5 0.00143
171 5 0.00144
179 5 0.00155
186 5 0.00129
197 5 0.00142
245 5 0.00155
2510 5 0.00189
19 4 0.000897
29 4 0.000913
36 4 0.000968
55 4 0.000637
61 4 0.000948
64 4 0.00115
80 4 0.00101
83 4 0.00106
95 4 0.00112
96 4 0.00111
100 4 0.00113
106 4 0.001
114 4 0.00123
115 4 0.00092
117 4 0.00106
125 4 0.00119
150 4 0.00111
152 4 0.000921
158 4 0.00112
160 4 0.00115
161 4 0.00102
168 4 0.00106
169 4 0.00119
172 4 0.00106
174 4 0.00109
199 4 0.00138
211 4 0.00127
32 3 0.000738
39 3 0.000744
41 3 0.000543
46 3 0.000722
56 3 0.00105
68 3 0.000743
74 3 0.000742
81 3 0.000623
89 3 0.000766
90 3 0.000602
101 3 0.000729
104 3 0.000872
110 3 0.000861
111 3 0.000585
116 3 0.000646
118 3 0.000878
119 3 0.000948
126 3 0.000801
133 3 0.000563
137 3 0.000844
138 3 0.000895
140 3 0.000662
141 3 0.000779
142 3 0.000872
147 3 0.000576
154 3 0.000946
156 3 0.000868
167 3 0.00076
170 3 0.000813
181 3 0.00089
182 3 0.000881
187 3 0.000922
189 3 0.000837
198 3 0.000987
200 3 0.000866
203 3 0.000944
206 3 0.000973
234 3 0.00107
9960 3 0.00114
10500 3 0.00114
12800 3 0.00114
32000 3 0.00114
75100 3 0.00114
52 2 0.000453
54 2 0.000555
60 2 0.000545
73 2 0.000579
82 2 0.000557
109 2 0.000604
112 2 0.00061
121 2 0.000638
122 2 0.000523
127 2 0.000526
128 2 0.000602
129 2 0.000622
131 2 0.000691
146 2 0.000596
157 2 0.000589
162 2 0.000528
165 2 0.000527
166 2 0.000606
173 2 0.000642
175 2 0.000623
177 2 0.000652
183 2 0.000589
193 2 0.000649
195 2 0.000667
204 2 0.000679
208 2 0.00066
213 2 0.00054
222 2 0.000667
227 2 0.000681
228 2 0.000697
230 2 0.000716
248 2 0.000703
259 2 0.000703
267 2 0.000665
268 2 0.000693
274 2 0.000736
284 2 0.000711
339 2 0.000736
2270 2 0.000756
3970 2 0.000757
4040 2 0.000757
6580 2 0.000758
6630 2 0.000757
7550 2 0.000758
8150 2 0.000758
20400 2 0.000758
25400 2 0.000758
33100 2 0.000758
33700 2 0.000758
40800 2 0.000758
43900 2 0.000758
51200 2 0.000758
64600 2 0.000758
68500 2 0.000758
87100 2 0.000758
127000 2 0.000758
141000 2 0.000758
146000 2 0.000758
162000 2 0.000758
163000 2 0.000758
166000 2 0.000758
167000 2 0.000758
184000 2 0.000758
186000 2 0.000758
186000 2 0.000758
193000 2 0.000758
282000 2 0.000758
305000 2 0.000758
342000 2 0.000758
42 1 0.000228
50 1 0.000237
51 1 0.000184
53 1 0.000184
65 1 0.000257
69 1 0.000273
77 1 0.000259
78 1 0.000197
79 1 0.000201
88 1 0.000205
97 1 0.000241
107 1 0.000301
108 1 0.000292
120 1 0.000257
124 1 0.000285
136 1 0.000312
139 1 0.00027
143 1 0.000263
149 1 0.000303
159 1 0.000292
176 1 0.000321
184 1 0.000329
185 1 0.000293
188 1 0.000365
190 1 0.000296
192 1 0.000364
194 1 0.000355
202 1 0.00034
205 1 0.000307
219 1 0.000341
220 1 0.000331
223 1 0.000337
229 1 0.000308
236 1 0.000372
238 1 0.000343
239 1 0.00034
242 1 0.000323
243 1 0.00031
247 1 0.00032
250 1 0.000358
253 1 0.000332
255 1 0.000325
256 1 0.000348
263 1 0.00032
273 1 0.000326
276 1 0.000331
282 1 0.000358
289 1 0.000366
294 1 0.000358
296 1 0.000372
297 1 0.000363
299 1 0.000372
300 1 0.000366
302 1 0.000365
303 1 0.000365
304 1 0.000374
305 1 0.000373
306 1 0.000357
307 1 0.000364
310 1 0.000376
319 1 0.000362
320 1 0.000374
322 1 0.000369
323 1 0.00037
327 1 0.000366
332 1 0.000366
344 1 0.000367
346 1 0.000368
353 1 0.000371
355 1 0.000369
356 1 0.000366
358 1 0.000373
359 1 0.000376
390 1 0.000373
403 1 0.000368
426 1 0.000369
433 1 0.00037
449 1 0.000373
455 1 0.000373
458 1 0.000372
501 1 0.000374
523 1 0.000375
535 1 0.000375
546 1 0.000374
603 1 0.000375
650 1 0.000376
688 1 0.000374
723 1 0.000377
730 1 0.000375
744 1 0.000376
795 1 0.000376
801 1 0.000378
978 1 0.000376
1100 1 0.000377
1110 1 0.000378
1370 1 0.000378
1470 1 0.000378
1720 1 0.000378
1970 1 0.000378
2200 1 0.000378
2460 1 0.000378
2510 1 0.000378
2560 1 0.000378
2600 1 0.000378
2860 1 0.000378
3150 1 0.000378
3220 1 0.000378
3240 1 0.000378
3300 1 0.000378
3820 1 0.000379
4520 1 0.000379
5270 1 0.000379
5400 1 0.000379
5600 1 0.000379
6050 1 0.000379
6100 1 0.000379
6290 1 0.000379
6900 1 0.000379
7640 1 0.000379
7650 1 0.000379
8330 1 0.000379
8400 1 0.000379
8470 1 0.000379
8570 1 0.000379
8770 1 0.000379
10100 1 0.000379
10200 1 0.000379
10400 1 0.000379
10600 1 0.000379
10800 1 0.000379
10900 1 0.000379
12500 1 0.000379
13600 1 0.000379
13600 1 0.000379
14500 1 0.000379
15900 1 0.000379
15900 1 0.000379
16000 1 0.000379
16400 1 0.000379
18800 1 0.000379
19900 1 0.000379
20200 1 0.000379
20400 1 0.000379
20900 1 0.000379
21300 1 0.000379
22100 1 0.000379
23300 1 0.000379
23600 1 0.000379
23900 1 0.000379
24800 1 0.000379
26400 1 0.000379
26900 1 0.000379
27800 1 0.000379
27800 1 0.000379
27900 1 0.000379
28600 1 0.000379
29500 1 0.000379
30300 1 0.000379
30900 1 0.000379
31400 1 0.000379
32900 1 0.000379
34700 1 0.000379
34900 1 0.000379
35600 1 0.000379
35700 1 0.000379
36600 1 0.000379
36600 1 0.000379
37500 1 0.000379
38300 1 0.000379
39100 1 0.000379
40400 1 0.000379
40900 1 0.000379
42200 1 0.000379
42300 1 0.000379
43000 1 0.000379
43100 1 0.000379
46400 1 0.000379
46800 1 0.000379
47500 1 0.000379
48400 1 0.000379
48700 1 0.000379
48900 1 0.000379
51500 1 0.000379
53900 1 0.000379
54300 1 0.000379
54600 1 0.000379
54800 1 0.000379
55600 1 0.000379
56900 1 0.000379
59600 1 0.000379
59800 1 0.000379
61300 1 0.000379
61700 1 0.000379
62500 1 0.000379
64400 1 0.000379
66100 1 0.000379
70600 1 0.000379
71500 1 0.000379
72600 1 0.000379
72600 1 0.000379
72800 1 0.000379
73800 1 0.000379
74100 1 0.000379
75100 1 0.000379
76100 1 0.000379
76200 1 0.000379
76300 1 0.000379
77300 1 0.000379
78000 1 0.000379
79800 1 0.000379
80400 1 0.000379
82100 1 0.000379
83500 1 0.000379
83800 1 0.000379
84900 1 0.000379
88300 1 0.000379
89600 1 0.000379
96200 1 0.000379
97700 1 0.000379
97900 1 0.000379
98100 1 0.000379
1e+05 1 0.000379
104000 1 0.000379
105000 1 0.000379
105000 1 0.000379
106000 1 0.000379
108000 1 0.000379
111000 1 0.000379
124000 1 0.000379
126000 1 0.000379
126000 1 0.000379
131000 1 0.000379
133000 1 0.000379
134000 1 0.000379
135000 1 0.000379
136000 1 0.000379
143000 1 0.000379
144000 1 0.000379
147000 1 0.000379
150000 1 0.000379
159000 1 0.000379
160000 1 0.000379
167000 1 0.000379
169000 1 0.000379
174000 1 0.000379
174000 1 0.000379
179000 1 0.000379
181000 1 0.000379
187000 1 0.000379
190000 1 0.000379
190000 1 0.000379
196000 1 0.000379
199000 1 0.000379
199000 1 0.000379
208000 1 0.000379
219000 1 0.000379
223000 1 0.000379
226000 1 0.000379
233000 1 0.000379
241000 1 0.000379
247000 1 0.000379
249000 1 0.000379
252000 1 0.000379
258000 1 0.000379
262000 1 0.000379
267000 1 0.000379
267000 1 0.000379
270000 1 0.000379
272000 1 0.000379
278000 1 0.000379
279000 1 0.000379
282000 1 0.000379
284000 1 0.000379
287000 1 0.000379
287000 1 0.000379
290000 1 0.000379
291000 1 0.000379
293000 1 0.000379
295000 1 0.000379
303000 1 0.000379
304000 1 0.000379
307000 1 0.000379
308000 1 0.000379
308000 1 0.000379
311000 1 0.000379
312000 1 0.000379
313000 1 0.000379
318000 1 0.000379
320000 1 0.000379
326000 1 0.000379
328000 1 0.000379
340000 1 0.000379
340000 1 0.000379
344000 1 0.000379
345000 1 0.000379
350000 1 0.000379

CL22 ----> CL16

image

No. of shared pairs: :951

CL22 ----> CL18

image

No. of shared pairs: :755

CL22 ----> CL59

image

No. of shared pairs: :473

CL22 ----> CL148

image

No. of shared pairs: :212

CL22 ----> CL191

image

No. of shared pairs: :62

CL22 ----> CL618

image

No. of shared pairs: :32

CL22 ----> CL541

image

No. of shared pairs: :21

CL22 ----> CL31

image

No. of shared pairs: :19

CL22 ----> CL2

image

No. of shared pairs: :16

CL22 ----> CL17

image

No. of shared pairs: :16

CL22 ----> CL20

image

No. of shared pairs: :16

CL22 ----> CL4

image

No. of shared pairs: :15

CL22 ----> CL12

image

No. of shared pairs: :15

CL22 ----> CL28

image

No. of shared pairs: :14

CL22 ----> CL45

image

No. of shared pairs: :14

CL22 ----> CL66

image

No. of shared pairs: :14

CL22 ----> CL3

image

No. of shared pairs: :13

CL22 ----> CL15

image

No. of shared pairs: :13

CL22 ----> CL24

image

No. of shared pairs: :13

CL22 ----> CL44

image

No. of shared pairs: :13

CL22 ----> CL649

image

No. of shared pairs: :13

CL22 ----> CL7

image

No. of shared pairs: :11

CL22 ----> CL9

image

No. of shared pairs: :11

CL22 ----> CL23

image

No. of shared pairs: :11

CL22 ----> CL40

image

No. of shared pairs: :11

CL22 ----> CL47

image

No. of shared pairs: :11

CL22 ----> CL102

image

No. of shared pairs: :11

CL22 ----> CL1

image

No. of shared pairs: :10

CL22 ----> CL43

image

No. of shared pairs: :10