Cluster no. 46

Go back to cluster table

Cluster is part of supercluster: 8

Cluster characteristics:

size 21994
size_real 21994
ecount 226491
supercluster 8
annotations_summary 0.00% organelle/plastid
pair_completeness 0.757411106671994
pbs_score None
TR_score None
TR_monomer_length None
loop_index 0.00645630626534509
satellite_probability 6.61373821909388e-22
consensus None
TAREAN_annotation Other
orientation_score 1

protein domains:

protein domains:


Reads annotation summary

  cl_string domain Freq proportion
plastid plastid 1 4.5e-05

clusters with similarity:

Cluster Number of similarity hits
14 829
15 1
120 1
264 1

clusters connected through mates:

Cluster Number of shared
read pairs
k
14 990 0.207
519 23 0.0148
676 21 0.0136
15 20 0.00524
31 14 0.00218
3 12 0.00237
1110 12 0.00783
92 11 0.0052
1810 10 0.00655
17 9 0.00126
1430 9 0.00587
74 8 0.00273
709 8 0.00521
6100 8 0.00525
4 7 0.00144
23 7 0.00185
72 7 0.00255
102 7 0.00184
129 7 0.00334
4170 7 0.00459
6 6 0.00115
33 6 0.00215
67 6 0.00166
70 6 0.00255
96 6 0.00241
98 6 0.00252
1530 6 0.00392
2370 6 0.00393
2 5 0.000717
5 5 0.00165
7 5 0.000843
9 5 0.00123
16 5 0.00126
26 5 0.00142
30 5 0.000993
50 5 0.00161
58 5 0.00215
66 5 0.00118
84 5 0.00165
169 5 0.00224
1540 5 0.00326
1750 5 0.00328
2190 5 0.00328
3040 5 0.00327
3430 5 0.00328
5120 5 0.00328
6780 5 0.00329
19400 5 0.00329
28900 5 0.00329
19 4 0.0012
29 4 0.00123
38 4 0.00149
39 4 0.00137
40 4 0.000802
41 4 0.000909
82 4 0.00162
90 4 0.00104
95 4 0.00164
134 4 0.00146
182 4 0.00175
1220 4 0.00262
1380 4 0.00262
4530 4 0.00263
5520 4 0.00263
7230 4 0.00263
12500 4 0.00263
14000 4 0.00263
19100 4 0.00263
42400 4 0.00263
1 3 0.000607
10 3 0.00105
12 3 0.000548
21 3 0.000795
22 3 0.000722
35 3 0.000644
37 3 0.000661
44 3 0.000677
47 3 0.000763
53 3 0.000695
62 3 0.000728
80 3 0.00106
83 3 0.00112
89 3 0.00107
97 3 0.000987
127 3 0.00112
141 3 0.0011
144 3 0.00149
163 3 0.00108
171 3 0.00128
179 3 0.00142
196 3 0.00117
228 3 0.00171
1460 3 0.00197
2500 3 0.00197
4620 3 0.00197
6200 3 0.00197
7040 3 0.00197
9930 3 0.00197
10300 3 0.00197
10600 3 0.00197
11600 3 0.00197
14200 3 0.00197
14300 3 0.00197
15200 3 0.00197
18900 3 0.00197
20600 3 0.00197
21300 3 0.00197
22100 3 0.00197
22100 3 0.00197
22500 3 0.00197
26500 3 0.00197
34200 3 0.00197
41500 3 0.00197
42300 3 0.00197
44700 3 0.00197
47600 3 0.00197
54500 3 0.00197
55800 3 0.00197
68700 3 0.00197
76700 3 0.00197
8 2 0.000654
18 2 0.00061
20 2 0.000411
25 2 0.000608
28 2 0.000691
36 2 0.000664
48 2 0.000429
49 2 0.000634
51 2 0.000465
55 2 0.000388
56 2 0.00115
65 2 0.000723
68 2 0.000685
71 2 0.000539
73 2 0.000856
79 2 0.000518
81 2 0.000541
100 2 0.000823
104 2 0.000861
110 2 0.000845
115 2 0.000619
118 2 0.00087
122 2 0.00074
125 2 0.000889
128 2 0.000907
130 2 0.000569
132 2 0.000889
133 2 0.000475
135 2 0.000813
150 2 0.000808
152 2 0.00062
164 2 0.00116
166 2 0.000917
180 2 0.00104
183 2 0.000879
197 2 0.000828
230 2 0.0012
264 2 0.00115
275 2 0.00127
742 2 0.0013
814 2 0.0013
920 2 0.00131
3790 2 0.00131
5820 2 0.00131
5940 2 0.00132
6850 2 0.00131
8450 2 0.00131
8620 2 0.00131
8660 2 0.00132
10200 2 0.00132
10600 2 0.00132
10700 2 0.00132
12900 2 0.00131
13100 2 0.00132
13100 2 0.00131
14500 2 0.00131
15200 2 0.00132
15200 2 0.00131
17300 2 0.00131
18000 2 0.00131
19300 2 0.00131
20700 2 0.00131
21000 2 0.00132
21900 2 0.00132
24700 2 0.00132
26000 2 0.00132
27000 2 0.00132
28400 2 0.00132
29200 2 0.00132
31700 2 0.00132
32600 2 0.00132
35500 2 0.00132
35800 2 0.00132
36200 2 0.00132
36900 2 0.00132
38300 2 0.00132
38400 2 0.00132
40300 2 0.00132
41200 2 0.00132
42600 2 0.00132
56100 2 0.00132
57900 2 0.00132
58500 2 0.00132
61800 2 0.00132
66000 2 0.00132
66400 2 0.00132
67200 2 0.00132
69900 2 0.00132
71500 2 0.00132
76300 2 0.00132
76500 2 0.00132
79700 2 0.00132
83700 2 0.00132
84000 2 0.00132
96300 2 0.00132
96400 2 0.00132
107000 2 0.00132
113000 2 0.00132
113000 2 0.00132
136000 2 0.00132
146000 2 0.00132
155000 2 0.00132
165000 2 0.00132
167000 2 0.00132
175000 2 0.00132
178000 2 0.00132
178000 2 0.00132
181000 2 0.00132
184000 2 0.00132
184000 2 0.00132
188000 2 0.00132
197000 2 0.00132
211000 2 0.00132
213000 2 0.00132
250000 2 0.00132
264000 2 0.00132
267000 2 0.00132
283000 2 0.00132
294000 2 0.00132
3e+05 2 0.00132
301000 2 0.00132
305000 2 0.00132
323000 2 0.00132
327000 2 0.00132
340000 2 0.00132
341000 2 0.00132
11 1 0.000201
13 1 0.000341
24 1 0.000222
27 1 0.000358
32 1 0.00034
34 1 0.000262
43 1 0.000248
45 1 0.000244
52 1 0.000303
57 1 0.000398
59 1 0.000389
61 1 0.000323
64 1 0.000422
69 1 0.000394
76 1 0.000354
77 1 0.000365
78 1 0.000253
85 1 0.000356
87 1 0.000358
88 1 0.000265
93 1 0.000441
101 1 0.000334
105 1 0.000341
106 1 0.000347
107 1 0.000454
108 1 0.000434
111 1 0.000249
112 1 0.000463
113 1 0.000361
114 1 0.000468
119 1 0.000489
120 1 0.00036
121 1 0.000496
123 1 0.000397
126 1 0.000381
131 1 0.000563
136 1 0.000478
137 1 0.000411
138 1 0.000448
142 1 0.000431
143 1 0.000373
145 1 0.000345
147 1 0.000244
153 1 0.000359
154 1 0.000487
155 1 0.000447
157 1 0.00044
158 1 0.000408
161 1 0.000357
165 1 0.000374
170 1 0.000389
172 1 0.000376
176 1 0.000501
178 1 0.000506
185 1 0.000436
200 1 0.000426
204 1 0.000548
205 1 0.000467
207 1 0.000564
219 1 0.000551
220 1 0.000525
222 1 0.000531
224 1 0.000624
227 1 0.00055
231 1 0.000587
233 1 0.000598
241 1 0.000557
242 1 0.000506
244 1 0.000615
245 1 0.000473
247 1 0.000498
262 1 0.000636
266 1 0.000588
289 1 0.000618
307 1 0.000613
324 1 0.000599
328 1 0.000613
349 1 0.000623
389 1 0.000629
390 1 0.000639
504 1 0.000651
649 1 0.000649
663 1 0.000654
721 1 0.000647
873 1 0.00065
880 1 0.000652
1290 1 0.000654
1320 1 0.000654
1370 1 0.000654
1500 1 0.000656
1750 1 0.000653
2170 1 0.000654
2250 1 0.000657
2280 1 0.000655
2620 1 0.000655
2740 1 0.000655
3110 1 0.000656
3500 1 0.000657
3580 1 0.000656
3880 1 0.000656
4570 1 0.000657
4640 1 0.000658
5030 1 0.000656
5090 1 0.000658
5600 1 0.000657
5880 1 0.000657
6080 1 0.000656
6140 1 0.000657
6330 1 0.000658
6480 1 0.000657
7380 1 0.000658
7450 1 0.000658
8430 1 0.000657
9640 1 0.000657
10200 1 0.000657
10300 1 0.000657
11000 1 0.000657
11400 1 0.000658
11800 1 0.000657
12300 1 0.000657
12900 1 0.000658
13000 1 0.000658
13300 1 0.000658
13700 1 0.000657
14200 1 0.000658
15000 1 0.000658
15800 1 0.000658
16900 1 0.000658
17500 1 0.000657
17700 1 0.000658
17700 1 0.000657
18800 1 0.000658
18800 1 0.000658
19800 1 0.000658
20900 1 0.000658
21200 1 0.000658
22300 1 0.000658
22500 1 0.000658
25200 1 0.000658
26700 1 0.000658
28000 1 0.000658
28400 1 0.000659
30500 1 0.000658
30800 1 0.000658
31300 1 0.000658
31300 1 0.000658
33300 1 0.000658
34000 1 0.000658
35000 1 0.000658
35000 1 0.000658
35400 1 0.000658
37000 1 0.000658
37900 1 0.000658
39200 1 0.000658
40000 1 0.000658
40300 1 0.000658
41400 1 0.000658
41700 1 0.000658
42600 1 0.000658
43900 1 0.000658
43900 1 0.000658
45400 1 0.000658
46300 1 0.000658
47000 1 0.000659
47400 1 0.000658
48900 1 0.000658
48900 1 0.000658
49400 1 0.000658
49600 1 0.000659
52000 1 0.000658
52300 1 0.000658
53600 1 0.000658
53800 1 0.000658
54900 1 0.000658
55500 1 0.000659
56000 1 0.000658
56900 1 0.000659
57100 1 0.000659
58800 1 0.000659
59300 1 0.000659
60700 1 0.000658
61400 1 0.000658
61600 1 0.000659
62600 1 0.000659
63800 1 0.000658
64000 1 0.000658
64800 1 0.000659
65700 1 0.000659
68300 1 0.000659
70400 1 0.000658
71100 1 0.000658
71600 1 0.000658
71900 1 0.000658
74200 1 0.000659
75600 1 0.000658
76600 1 0.000659
79000 1 0.000659
79900 1 0.000659
80100 1 0.000658
80600 1 0.000658
81400 1 0.000658
82600 1 0.000659
82700 1 0.000658
84400 1 0.000659
89300 1 0.000658
89700 1 0.000658
90400 1 0.000658
91400 1 0.000658
95400 1 0.000658
98300 1 0.000658
99200 1 0.000658
1e+05 1 0.000658
103000 1 0.000658
106000 1 0.000658
111000 1 0.000658
112000 1 0.000658
115000 1 0.000658
116000 1 0.000658
117000 1 0.000658
125000 1 0.000658
128000 1 0.000658
128000 1 0.000658
134000 1 0.000658
135000 1 0.000658
140000 1 0.000658
141000 1 0.000658
145000 1 0.000658
146000 1 0.000658
148000 1 0.000658
151000 1 0.000658
152000 1 0.000658
160000 1 0.000658
160000 1 0.000658
163000 1 0.000658
166000 1 0.000658
174000 1 0.000658
176000 1 0.000658
178000 1 0.000658
179000 1 0.000658
180000 1 0.000658
182000 1 0.000658
185000 1 0.000658
186000 1 0.000658
190000 1 0.000658
192000 1 0.000658
192000 1 0.000658
195000 1 0.000658
197000 1 0.000658
199000 1 0.000658
199000 1 0.000658
2e+05 1 0.000658
2e+05 1 0.000658
204000 1 0.000658
215000 1 0.000658
216000 1 0.000658
221000 1 0.000658
223000 1 0.000658
226000 1 0.000658
232000 1 0.000658
239000 1 0.000658
245000 1 0.000658
247000 1 0.000658
252000 1 0.000658
255000 1 0.000658
256000 1 0.000658
257000 1 0.000658
260000 1 0.000658
264000 1 0.000658
264000 1 0.000658
265000 1 0.000658
266000 1 0.000658
268000 1 0.000658
271000 1 0.000658
277000 1 0.000658
279000 1 0.000658
284000 1 0.000658
284000 1 0.000658
289000 1 0.000658
289000 1 0.000658
293000 1 0.000658
299000 1 0.000658
301000 1 0.000658
306000 1 0.000658
317000 1 0.000658
324000 1 0.000658
333000 1 0.000658
333000 1 0.000658
334000 1 0.000658
340000 1 0.000658
342000 1 0.000658
349000 1 0.000658

CL46 ----> CL14

image

No. of shared pairs: :990

CL46 ----> CL519

image

No. of shared pairs: :23

CL46 ----> CL676

image

No. of shared pairs: :21

CL46 ----> CL15

image

No. of shared pairs: :20

CL46 ----> CL31

image

No. of shared pairs: :14

CL46 ----> CL3

image

No. of shared pairs: :12

CL46 ----> CL1107

image

No. of shared pairs: :12

CL46 ----> CL92

image

No. of shared pairs: :11

CL46 ----> CL1806

image

No. of shared pairs: :10