| size | 21120 |
| size_real | 21120 |
| ecount | 1073642 |
| supercluster | 11 |
| annotations_summary | 11.57% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/CRM:Ty3-GAG 6.81% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/CRM:Ty3-PROT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/CRM:Ty3-RT 0.00% Class_II/Subclass_1/TIR/EnSpm_CACTA:CACTA-TPase 0.00% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-RT 0.00% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-RT 0.00% Class_I/LTR/Ty1_copia/Alesia:Ty1-RT |
| pair_completeness | 0.731289449954914 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.000615530303030303 |
| satellite_probability | 9.81425038973844e-23 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
protein domains:
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CL49 ----> CL36
No. of shared pairs: :495
CL49 ----> CL138
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CL49 ----> CL258
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CL49 ----> CL347
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CL49 ----> CL139
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CL49 ----> CL17
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CL49 ----> CL466
No. of shared pairs: :18
CL49 ----> CL3
No. of shared pairs: :14
CL49 ----> CL31
No. of shared pairs: :14
CL49 ----> CL87
No. of shared pairs: :13
CL49 ----> CL6
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CL49 ----> CL7
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CL49 ----> CL26
No. of shared pairs: :10
CL49 ----> CL29
No. of shared pairs: :10
CL49 ----> CL85
No. of shared pairs: :10