| size | 20162 |
| size_real | 20162 |
| ecount | 376236 |
| supercluster | 21 |
| annotations_summary | 8.66% Class_I/LTR/Ty1_copia/Gymco-II:Ty1-RT 4.75% Class_I/LTR/Ty1_copia/Gymco-II:Ty1-INT 0.85% Class_I/LTR/Ty1_copia/Gymco-II:Ty1-PROT 0.73% Class_I/LTR/Ty1_copia/Tork:Ty1-INT 0.72% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-RH 0.54% organelle/mitochondria 0.51% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-RT 0.51% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-INT 0.25% Class_I/LTR/Ty1_copia/Alesia:Ty1-RH 0.25% Class_I/LTR/Ty1_copia/Gymco-II:Ty1-RH 0.19% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-RT 0.16% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-RH 0.15% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-PROT 0.10% Class_I/LTR/Ty1_copia/Angela:Ty1-INT 0.08% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-RT 0.07% Class_I/LTR/Ty1_copia/Gymco-I:Ty1-RT 0.06% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ikeros:Ty1-RT 0.05% Class_I/LTR/Ty1_copia/TAR:Ty1-PROT 0.03% Class_I/LTR/Ty1_copia/Alesia:Ty1-RT 0.03% Class_I/LTR/Ty1_copia/Bryco:Ty1-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ty1-outgroup:Ty1-RH 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-PROT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Tork:Ty1-PROT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Bryco:Ty1-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Tork:Ty1-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ty1-outgroup:Ty1-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-PROT 0.00% Class_I/LTR/Ty1_copia/Tork:Ty1-RH 0.00% Class_I/LTR/Ty1_copia/Angela:Ty1-RT 0.00% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/CRM:Ty3-INT 0.00% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Reina:Ty3-INT |
| pair_completeness | 0.566832452595586 |
| pbs_score | None |
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| TR_monomer_length | None |
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| satellite_probability | 1.13992396794032e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
protein domains:
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CL51 ----> CL78
No. of shared pairs: :583
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CL51 ----> CL7
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CL51 ----> CL2
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CL51 ----> CL30
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CL51 ----> CL200
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CL51 ----> CL81
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CL51 ----> CL17
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CL51 ----> CL21
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CL51 ----> CL214
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CL51 ----> CL151
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CL51 ----> CL3257
No. of shared pairs: :10