| size | 16085 |
| size_real | 16085 |
| ecount | 1421147 |
| supercluster | 21 |
| annotations_summary | 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/chromo-unclass:Ty3-RH 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Gymco-II:Ty1-RH 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Gymco-II:Ty1-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Reina:Ty3-PROT |
| pair_completeness | 0.534242655475009 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00310848616723656 |
| satellite_probability | 1.86264069827155e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
protein domains:
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CL78 ----> CL51
No. of shared pairs: :583
CL78 ----> CL11
No. of shared pairs: :424
CL78 ----> CL352
No. of shared pairs: :73
CL78 ----> CL2
No. of shared pairs: :63
CL78 ----> CL165
No. of shared pairs: :57
CL78 ----> CL7
No. of shared pairs: :39
CL78 ----> CL143
No. of shared pairs: :39
CL78 ----> CL30
No. of shared pairs: :36
CL78 ----> CL68
No. of shared pairs: :33
CL78 ----> CL81
No. of shared pairs: :31
CL78 ----> CL122
No. of shared pairs: :20
CL78 ----> CL200
No. of shared pairs: :18
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No. of shared pairs: :14
CL78 ----> CL17
No. of shared pairs: :13
CL78 ----> CL161
No. of shared pairs: :12
CL78 ----> CL48
No. of shared pairs: :11
CL78 ----> CL126
No. of shared pairs: :11
CL78 ----> CL173
No. of shared pairs: :11