| size | 13733 |
| size_real | 13733 |
| ecount | 2455017 |
| supercluster | 1 |
| annotations_summary | 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatIII:Ty3-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Reina:Ty3-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Athila:Ty3-GAG 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/CRM:Ty3-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Tork:Ty1-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Gymco-II:Ty1-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/CRM:Ty3-CHDII |
| pair_completeness | 0.501038364848617 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00458815818221543 |
| satellite_probability | 2.60623974767306e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 0.999999592706514 |
protein domains:
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
CL102 ----> CL41
No. of shared pairs: :1904
CL102 ----> CL1
No. of shared pairs: :1019
CL102 ----> CL4
No. of shared pairs: :377
CL102 ----> CL31
No. of shared pairs: :19
CL102 ----> CL27
No. of shared pairs: :17
CL102 ----> CL35
No. of shared pairs: :15
CL102 ----> CL9
No. of shared pairs: :12
CL102 ----> CL16
No. of shared pairs: :12
CL102 ----> CL18
No. of shared pairs: :12
CL102 ----> CL12
No. of shared pairs: :11
CL102 ----> CL22
No. of shared pairs: :11
CL102 ----> CL79
No. of shared pairs: :11
CL102 ----> CL80
No. of shared pairs: :11
CL102 ----> CL2
No. of shared pairs: :10
CL102 ----> CL3
No. of shared pairs: :10
CL102 ----> CL13
No. of shared pairs: :10
CL102 ----> CL33
No. of shared pairs: :10
CL102 ----> CL40
No. of shared pairs: :10
CL102 ----> CL52
No. of shared pairs: :10
CL102 ----> CL55
No. of shared pairs: :10
CL102 ----> CL77
No. of shared pairs: :10