Cluster no. 115

Go back to cluster table

Cluster is part of supercluster: 55

Cluster characteristics:

size 12609
size_real 12609
ecount 137776
supercluster 55
annotations_summary
pair_completeness 0.573175296319401
pbs_score None
TR_score None
TR_monomer_length None
loop_index 0.000317233721944643
satellite_probability 1.13992396794032e-21
consensus None
TAREAN_annotation Other
orientation_score 1

protein domains:

No protein domains detected

protein domains:


Reads annotation summary

No similarity hits to repeat databases found

clusters with similarity:

Cluster Number of similarity hits
24 128
90 5
17 3
88 1
170 1
182 1

clusters connected through mates:

Cluster Number of shared
read pairs
k
24 389 0.083
17 27 0.00367
90 22 0.00543
48 10 0.00206
72 9 0.00306
4 8 0.00159
2770 8 0.00465
14 7 0.00141
29 7 0.00202
50 7 0.00213
5490 7 0.00408
2 6 0.000838
16 6 0.00144
31 6 0.000908
40 6 0.00116
63 6 0.0013
130 6 0.00162
3 5 0.000953
15 5 0.00125
30 5 0.000956
66 5 0.00113
86 5 0.00122
189 5 0.00188
987 5 0.00289
7040 5 0.00292
1 4 0.000779
9 4 0.000937
19 4 0.00113
22 4 0.00092
25 4 0.00115
68 4 0.00128
74 4 0.00128
81 4 0.00103
85 4 0.00133
97 4 0.00124
134 4 0.00136
156 4 0.00158
179 4 0.00174
182 4 0.00161
3750 4 0.00233
8770 4 0.00233
16500 4 0.00234
6 3 0.000555
7 3 0.00049
13 3 0.000961
18 3 0.000864
23 3 0.000753
33 3 0.00101
36 3 0.000936
41 3 0.000653
43 3 0.000709
44 3 0.000648
47 3 0.000728
67 3 0.00079
95 3 0.00114
98 3 0.00117
126 3 0.00106
148 3 0.0011
153 3 0.00101
161 3 0.001
172 3 0.00105
186 3 0.00101
3660 3 0.00175
4850 3 0.00175
11000 3 0.00175
41600 3 0.00175
70300 3 0.00175
11 2 0.000388
27 2 0.00067
28 2 0.000648
32 2 0.000638
34 2 0.000499
39 2 0.000644
46 2 0.000619
57 2 0.000739
58 2 0.000795
59 2 0.000723
76 2 0.000663
84 2 0.000621
100 2 0.000762
104 2 0.000795
106 2 0.000651
108 2 0.000802
111 2 0.000476
116 2 0.000538
120 2 0.000673
122 2 0.00069
139 2 0.000718
173 2 0.000913
176 2 0.000913
207 2 0.00102
229 2 0.000863
232 2 0.000953
245 2 0.000867
9790 2 0.00117
10500 2 0.00117
10600 2 0.00117
11000 2 0.00117
13300 2 0.00117
16300 2 0.00117
16500 2 0.00117
21300 2 0.00117
32900 2 0.00117
33600 2 0.00117
34200 2 0.00117
35900 2 0.00117
36300 2 0.00117
38800 2 0.00117
42800 2 0.00117
43600 2 0.00117
48600 2 0.00117
53200 2 0.00117
69200 2 0.00117
72200 2 0.00117
118000 2 0.00117
130000 2 0.00117
146000 2 0.00117
156000 2 0.00117
160000 2 0.00117
163000 2 0.00117
176000 2 0.00117
184000 2 0.00117
191000 2 0.00117
192000 2 0.00117
202000 2 0.00117
207000 2 0.00117
216000 2 0.00117
217000 2 0.00117
225000 2 0.00117
238000 2 0.00117
245000 2 0.00117
248000 2 0.00117
264000 2 0.00117
294000 2 0.00117
305000 2 0.00117
317000 2 0.00117
320000 2 0.00117
321000 2 0.00117
325000 2 0.00117
329000 2 0.00117
336000 2 0.00117
8 1 0.000308
10 1 0.000329
12 1 0.000176
20 1 0.000198
21 1 0.000252
35 1 0.000206
37 1 0.000211
45 1 0.000233
49 1 0.000299
51 1 0.000222
53 1 0.000222
54 1 0.000374
60 1 0.000364
61 1 0.000304
64 1 0.00039
69 1 0.000366
77 1 0.000341
78 1 0.000241
79 1 0.000247
80 1 0.000331
87 1 0.000335
88 1 0.000252
89 1 0.000335
91 1 0.000423
93 1 0.000407
94 1 0.000499
101 1 0.000314
109 1 0.000419
129 1 0.000437
132 1 0.00041
133 1 0.000227
135 1 0.000377
137 1 0.00038
140 1 0.000277
141 1 0.000342
143 1 0.000348
145 1 0.000323
151 1 0.000388
157 1 0.000405
158 1 0.000378
159 1 0.000401
163 1 0.000337
169 1 0.000412
170 1 0.000362
171 1 0.000394
181 1 0.000409
185 1 0.000402
187 1 0.000429
195 1 0.000483
197 1 0.000384
199 1 0.000506
204 1 0.000496
211 1 0.000452
216 1 0.000505
219 1 0.000498
222 1 0.000482
223 1 0.000491
230 1 0.000536
231 1 0.000528
237 1 0.000494
238 1 0.000502
239 1 0.000496
241 1 0.000503
242 1 0.000461
247 1 0.000455
256 1 0.000514
259 1 0.000522
290 1 0.000563
339 1 0.000558
402 1 0.000575
439 1 0.000572
535 1 0.000574
583 1 0.000571
593 1 0.00057
763 1 0.000578
838 1 0.000576
1010 1 0.000582
1120 1 0.00058
1180 1 0.000583
1330 1 0.000583
2100 1 0.000581
2810 1 0.000583
3590 1 0.000583
3920 1 0.000582
5610 1 0.000583
5970 1 0.000583
6170 1 0.000583
6460 1 0.000584
6600 1 0.000584
7020 1 0.000583
7440 1 0.000584
7530 1 0.000583
7980 1 0.000584
8740 1 0.000583
10400 1 0.000584
10600 1 0.000583
13000 1 0.000584
13800 1 0.000584
14200 1 0.000584
14500 1 0.000584
14600 1 0.000583
14700 1 0.000584
15000 1 0.000583
15100 1 0.000583
15200 1 0.000584
15600 1 0.000584
16000 1 0.000584
16800 1 0.000584
17100 1 0.000584
18700 1 0.000584
20300 1 0.000584
20500 1 0.000584
20900 1 0.000584
22100 1 0.000584
22200 1 0.000584
22200 1 0.000584
22700 1 0.000584
23100 1 0.000584
25400 1 0.000584
25700 1 0.000584
27400 1 0.000584
27900 1 0.000584
28300 1 0.000584
28400 1 0.000584
29100 1 0.000584
31100 1 0.000584
32200 1 0.000584
34400 1 0.000584
34900 1 0.000584
37000 1 0.000584
37200 1 0.000584
37500 1 0.000584
38200 1 0.000584
39700 1 0.000584
39700 1 0.000584
40800 1 0.000584
42700 1 0.000584
44500 1 0.000584
45400 1 0.000584
45600 1 0.000584
46500 1 0.000584
47400 1 0.000584
48000 1 0.000584
48500 1 0.000584
48800 1 0.000584
50100 1 0.000584
52000 1 0.000584
53600 1 0.000584
54900 1 0.000584
55500 1 0.000584
57000 1 0.000584
57100 1 0.000584
57200 1 0.000584
57300 1 0.000584
60900 1 0.000584
62700 1 0.000584
63800 1 0.000584
63900 1 0.000584
64500 1 0.000584
66000 1 0.000584
66700 1 0.000584
66700 1 0.000584
67500 1 0.000584
68000 1 0.000584
68900 1 0.000584
69000 1 0.000584
69400 1 0.000584
70200 1 0.000584
72600 1 0.000584
72700 1 0.000584
73500 1 0.000584
74500 1 0.000584
74700 1 0.000584
75600 1 0.000584
76100 1 0.000584
76100 1 0.000584
78000 1 0.000584
78100 1 0.000584
79300 1 0.000584
79300 1 0.000584
79500 1 0.000584
79700 1 0.000584
81300 1 0.000584
81400 1 0.000584
81500 1 0.000584
81600 1 0.000584
82400 1 0.000584
82500 1 0.000584
83000 1 0.000584
83700 1 0.000584
92700 1 0.000584
95100 1 0.000584
95400 1 0.000584
97700 1 0.000584
98400 1 0.000584
99700 1 0.000584
105000 1 0.000584
112000 1 0.000584
113000 1 0.000584
117000 1 0.000584
121000 1 0.000584
124000 1 0.000584
125000 1 0.000584
126000 1 0.000584
127000 1 0.000584
128000 1 0.000584
138000 1 0.000584
140000 1 0.000584
151000 1 0.000584
155000 1 0.000584
157000 1 0.000584
164000 1 0.000584
165000 1 0.000584
167000 1 0.000584
168000 1 0.000584
170000 1 0.000584
171000 1 0.000584
173000 1 0.000584
174000 1 0.000584
176000 1 0.000584
179000 1 0.000584
181000 1 0.000584
182000 1 0.000584
184000 1 0.000584
195000 1 0.000584
196000 1 0.000584
197000 1 0.000584
2e+05 1 0.000584
2e+05 1 0.000584
208000 1 0.000584
209000 1 0.000584
213000 1 0.000584
213000 1 0.000584
214000 1 0.000584
219000 1 0.000584
220000 1 0.000584
221000 1 0.000584
224000 1 0.000584
224000 1 0.000584
224000 1 0.000584
225000 1 0.000584
227000 1 0.000584
228000 1 0.000584
231000 1 0.000584
238000 1 0.000584
244000 1 0.000584
247000 1 0.000584
248000 1 0.000584
249000 1 0.000584
253000 1 0.000584
256000 1 0.000584
256000 1 0.000584
261000 1 0.000584
266000 1 0.000584
267000 1 0.000584
270000 1 0.000584
273000 1 0.000584
273000 1 0.000584
277000 1 0.000584
279000 1 0.000584
282000 1 0.000584
285000 1 0.000584
287000 1 0.000584
288000 1 0.000584
289000 1 0.000584
291000 1 0.000584
304000 1 0.000584
317000 1 0.000584
318000 1 0.000584
318000 1 0.000584
325000 1 0.000584
329000 1 0.000584
333000 1 0.000584
333000 1 0.000584
336000 1 0.000584
339000 1 0.000584
339000 1 0.000584
342000 1 0.000584
349000 1 0.000584
349000 1 0.000584

CL115 ----> CL24

image

No. of shared pairs: :389

CL115 ----> CL17

image

No. of shared pairs: :27

CL115 ----> CL90

image

No. of shared pairs: :22

CL115 ----> CL48

image

No. of shared pairs: :10