Cluster no. 123

Go back to cluster table

Cluster is part of supercluster: 60

Cluster characteristics:

size 11507
size_real 11507
ecount 396122
supercluster 60
annotations_summary 0.01% Class_II/Subclass_1/TIR/EnSpm_CACTA:CACTA-TPase
pair_completeness 0.703226761397276
pbs_score 0.86155906
TR_score 0.19916705882352942
TR_monomer_length 61.0
loop_index 0.730017452006981
satellite_probability 0.0210179687592549
consensus 
TGGTTGATTTTCATATTGAGACAATCTTTGTCACAATGCGACATTGGACCATGGTTGACCA

  

  

    TAREAN_annotation
    Putative satellite (low confidence)
  

  

    orientation_score
    0.99990688427225
  

 


 
 protein domains:



protein domains:


  





 
 Reads annotation summary










	

	 
	
 
		   
		cl_string  
		domain  
		Freq  
		proportion 
	
 

 
EnSpm_CACTA CACTA-TPase

EnSpm_CACTA

CACTA-TPase

1

8.7e-05


 
	


 

 


 
 clusters with similarity:



  

    
      



 

    Cluster
    Number of similarity hits
  

      

   		
 

 

   
     

       



  

    128
    1
  

  

    134
    1
  

  

    235
    1
  

  

    273
    1
  

       

     

  		
 




 
 clusters connected through mates:



  

    
      




 

    Cluster
    Number of shared
 read pairs		
    k
  

      

   		
 

 

   
     

       




  

    273
    30
    0.021
  

  

    17
    24
    0.00361
  

  

    16
    7
    0.00202
  

  

    213
    7
    0.00338
  

  

    15
    6
    0.00182
  

  

    22
    6
    0.00165
  

  

    84
    6
    0.00239
  

  

    128
    6
    0.00355
  

  

    20300
    6
    0.00597
  

  

    8
    5
    0.00197
  

  

    31
    5
    0.000847
  

  

    196
    5
    0.00245
  

  

    2
    4
    0.00062
  

  

    7
    4
    0.000738
  

  

    49
    4
    0.00151
  

  

    77
    4
    0.0018
  

  

    162
    4
    0.00186
  

  

    1310
    4
    0.00393
  

  

    3390
    4
    0.00397
  

  

    10900
    4
    0.00397
  

  

    4
    3
    0.000692
  

  

    6
    3
    0.000639
  

  

    18
    3
    0.00109
  

  

    24
    3
    0.000754
  

  

    26
    3
    0.000998
  

  

    50
    3
    0.00116
  

  

    59
    3
    0.00146
  

  

    63
    3
    0.000767
  

  

    65
    3
    0.00133
  

  

    74
    3
    0.00124
  

  

    89
    3
    0.00132
  

  

    163
    3
    0.00133
  

  

    170
    3
    0.00146
  

  

    178
    3
    0.00205
  

  

    180
    3
    0.00214
  

  

    197
    3
    0.00158
  

  

    203
    3
    0.00194
  

  

    243
    3
    0.00189
  

  

    276
    3
    0.00216
  

  

    313
    3
    0.00267
  

  

    14700
    3
    0.00299
  

  

    3
    2
    0.000441
  

  

    10
    2
    0.000858
  

  

    14
    2
    0.000469
  

  

    20
    2
    0.00046
  

  

    25
    2
    0.000721
  

  

    34
    2
    0.000607
  

  

    38
    2
    0.000925
  

  

    43
    2
    0.000568
  

  

    45
    2
    0.000558
  

  

    66
    2
    0.000535
  

  

    67
    2
    0.000647
  

  

    83
    2
    0.000928
  

  

    85
    2
    0.000873
  

  

    98
    2
    0.00107
  

  

    99
    2
    0.0012
  

  

    114
    2
    0.00123
  

  

    118
    2
    0.00112
  

  

    121
    2
    0.00133
  

  

    126
    2
    0.000948
  

  

    129
    2
    0.00127
  

  

    135
    2
    0.00103
  

  

    148
    2
    0.000988
  

  

    149
    2
    0.0012
  

  

    153
    2
    0.00088
  

  

    159
    2
    0.00112
  

  

    169
    2
    0.00116
  

  

    195
    2
    0.00147
  

  

    217
    2
    0.00133
  

  

    531
    2
    0.00193
  

  

    687
    2
    0.00193
  

  

    1540
    2
    0.00198
  

  

    2650
    2
    0.00198
  

  

    3250
    2
    0.00198
  

  

    11200
    2
    0.00199
  

  

    15500
    2
    0.00199
  

  

    20500
    2
    0.00199
  

  

    20600
    2
    0.00199
  

  

    27400
    2
    0.00199
  

  

    33900
    2
    0.00199
  

  

    36500
    2
    0.00199
  

  

    38000
    2
    0.00199
  

  

    38900
    2
    0.00199
  

  

    40900
    2
    0.00199
  

  

    51400
    2
    0.00199
  

  

    63300
    2
    0.00199
  

  

    74900
    2
    0.00199
  

  

    89600
    2
    0.00199
  

  

    94200
    2
    0.00199
  

  

    99000
    2
    0.00199
  

  

    101000
    2
    0.00199
  

  

    107000
    2
    0.00199
  

  

    108000
    2
    0.00199
  

  

    145000
    2
    0.00199
  

  

    145000
    2
    0.00199
  

  

    185000
    2
    0.00199
  

  

    214000
    2
    0.00199
  

  

    237000
    2
    0.00199
  

  

    239000
    2
    0.00199
  

  

    242000
    2
    0.00199
  

  

    244000
    2
    0.00199
  

  

    257000
    2
    0.00199
  

  

    268000
    2
    0.00199
  

  

    288000
    2
    0.00199
  

  

    297000
    2
    0.00199
  

  

    302000
    2
    0.00199
  

  

    325000
    2
    0.00199
  

  

    326000
    2
    0.00199
  

  

    1
    1
    0.000226
  

  

    9
    1
    0.000281
  

  

    11
    1
    0.000225
  

  

    12
    1
    0.000202
  

  

    13
    1
    0.000414
  

  

    27
    1
    0.000439
  

  

    29
    1
    0.000364
  

  

    33
    1
    0.00044
  

  

    35
    1
    0.000241
  

  

    36
    1
    4e-04
  

  

    37
    1
    0.000248
  

  

    40
    1
    0.000224
  

  

    41
    1
    0.000257
  

  

    46
    1
    0.000397
  

  

    47
    1
    0.000293
  

  

    48
    1
    0.000241
  

  

    52
    1
    0.00036
  

  

    55
    1
    0.000215
  

  

    56
    1
    0.000817
  

  

    61
    1
    0.000387
  

  

    64
    1
    0.000539
  

  

    69
    1
    0.000494
  

  

    72
    1
    0.000448
  

  

    73
    1
    0.000549
  

  

    75
    1
    0.000256
  

  

    76
    1
    0.000434
  

  

    81
    1
    0.000314
  

  

    86
    1
    0.000294
  

  

    90
    1
    0.000299
  

  

    93
    1
    0.000571
  

  

    96
    1
    0.000507
  

  

    105
    1
    0.000414
  

  

    106
    1
    0.000423
  

  

    108
    1
    0.00056
  

  

    112
    1
    0.000608
  

  

    117
    1
    0.000466
  

  

    119
    1
    0.000653
  

  

    122
    1
    0.000457
  

  

    125
    1
    0.000577
  

  

    132
    1
    0.000577
  

  

    134
    1
    0.000449
  

  

    137
    1
    0.000521
  

  

    139
    1
    0.000482
  

  

    140
    1
    0.000345
  

  

    143
    1
    0.000462
  

  

    144
    1
    0.000669
  

  

    151
    1
    0.000535
  

  

    152
    1
    0.000369
  

  

    156
    1
    0.000549
  

  

    157
    1
    0.000568
  

  

    158
    1
    0.000516
  

  

    165
    1
    0.000463
  

  

    166
    1
    6e-04
  

  

    173
    1
    0.000674
  

  

    176
    1
    0.000675
  

  

    181
    1
    0.000576
  

  

    182
    1
    0.000564
  

  

    186
    1
    0.000444
  

  

    187
    1
    0.000617
  

  

    189
    1
    0.000513
  

  

    191
    1
    0.00052
  

  

    202
    1
    0.000764
  

  

    208
    1
    0.000717
  

  

    216
    1
    0.000787
  

  

    221
    1
    0.000808
  

  

    229
    1
    0.000621
  

  

    231
    1
    0.000842
  

  

    232
    1
    0.000719
  

  

    235
    1
    0.000613
  

  

    242
    1
    0.000685
  

  

    250
    1
    0.000865
  

  

    260
    1
    0.000836
  

  

    267
    1
    0.000727
  

  

    272
    1
    0.000733
  

  

    287
    1
    0.000923
  

  

    292
    1
    0.000801
  

  

    316
    1
    0.000929
  

  

    317
    1
    0.000953
  

  

    321
    1
    0.000937
  

  

    324
    1
    0.000867
  

  

    360
    1
    0.000893
  

  

    362
    1
    0.000936
  

  

    371
    1
    0.000954
  

  

    389
    1
    0.00093
  

  

    418
    1
    0.000942
  

  

    428
    1
    0.000987
  

  

    456
    1
    0.000969
  

  

    474
    1
    0.000954
  

  

    492
    1
    0.000953
  

  

    622
    1
    0.000969
  

  

    896
    1
    0.00098
  

  

    929
    1
    0.000988
  

  

    1910
    1
    0.000988
  

  

    1970
    1
    0.000987
  

  

    2070
    1
    0.000994
  

  

    2180
    1
    0.000988
  

  

    2620
    1
    0.000993
  

  

    2940
    1
    0.000992
  

  

    2980
    1
    0.000991
  

  

    3200
    1
    0.000989
  

  

    3880
    1
    0.000992
  

  

    4050
    1
    0.000993
  

  

    4440
    1
    0.000993
  

  

    4800
    1
    0.000993
  

  

    5390
    1
    0.000993
  

  

    6360
    1
    0.000997
  

  

    6670
    1
    0.000993
  

  

    6760
    1
    0.000994
  

  

    7310
    1
    0.000995
  

  

    7500
    1
    0.000994
  

  

    7780
    1
    0.000994
  

  

    7870
    1
    0.000995
  

  

    8260
    1
    0.000996
  

  

    8590
    1
    0.000997
  

  

    10400
    1
    0.000994
  

  

    11100
    1
    0.000997
  

  

    11500
    1
    0.000994
  

  

    12300
    1
    0.000995
  

  

    13800
    1
    0.000996
  

  

    14600
    1
    0.000996
  

  

    16300
    1
    0.000996
  

  

    20600
    1
    0.000996
  

  

    23400
    1
    0.000996
  

  

    25400
    1
    0.000996
  

  

    26900
    1
    0.000996
  

  

    27800
    1
    0.000996
  

  

    28100
    1
    0.000995
  

  

    28800
    1
    0.000995
  

  

    29100
    1
    0.000996
  

  

    31800
    1
    0.000997
  

  

    33200
    1
    0.000997
  

  

    34400
    1
    0.000997
  

  

    35100
    1
    0.000997
  

  

    37100
    1
    0.000996
  

  

    39100
    1
    0.000997
  

  

    39600
    1
    0.000996
  

  

    46300
    1
    0.000996
  

  

    47800
    1
    0.000996
  

  

    48300
    1
    0.000996
  

  

    49200
    1
    0.000997
  

  

    49300
    1
    0.000997
  

  

    50200
    1
    0.000996
  

  

    52600
    1
    0.000996
  

  

    52700
    1
    0.000997
  

  

    54500
    1
    0.000997
  

  

    57800
    1
    0.000997
  

  

    61700
    1
    0.000996
  

  

    62700
    1
    0.000996
  

  

    63500
    1
    0.000997
  

  

    71700
    1
    0.000996
  

  

    73600
    1
    0.000997
  

  

    74500
    1
    0.000996
  

  

    76800
    1
    0.000997
  

  

    79900
    1
    0.000997
  

  

    80200
    1
    0.000996
  

  

    84200
    1
    0.000997
  

  

    89000
    1
    0.000997
  

  

    91500
    1
    0.000997
  

  

    92800
    1
    0.000997
  

  

    94000
    1
    0.000997
  

  

    99700
    1
    0.000997
  

  

    107000
    1
    0.000997
  

  

    117000
    1
    0.000997
  

  

    120000
    1
    0.000997
  

  

    122000
    1
    0.000997
  

  

    132000
    1
    0.000997
  

  

    135000
    1
    0.000997
  

  

    136000
    1
    0.000997
  

  

    140000
    1
    0.000997
  

  

    146000
    1
    0.000997
  

  

    147000
    1
    0.000997
  

  

    149000
    1
    0.000997
  

  

    159000
    1
    0.000997
  

  

    159000
    1
    0.000997
  

  

    165000
    1
    0.000997
  

  

    167000
    1
    0.000997
  

  

    168000
    1
    0.000997
  

  

    173000
    1
    0.000997
  

  

    175000
    1
    0.000997
  

  

    182000
    1
    0.000997
  

  

    190000
    1
    0.000997
  

  

    191000
    1
    0.000997
  

  

    196000
    1
    0.000997
  

  

    202000
    1
    0.000997
  

  

    202000
    1
    0.000997
  

  

    204000
    1
    0.000997
  

  

    206000
    1
    0.000997
  

  

    207000
    1
    0.000997
  

  

    230000
    1
    0.000997
  

  

    230000
    1
    0.000997
  

  

    236000
    1
    0.000997
  

  

    237000
    1
    0.000997
  

  

    240000
    1
    0.000997
  

  

    241000
    1
    0.000997
  

  

    241000
    1
    0.000997
  

  

    243000
    1
    0.000997
  

  

    246000
    1
    0.000997
  

  

    249000
    1
    0.000997
  

  

    261000
    1
    0.000997
  

  

    276000
    1
    0.000997
  

  

    277000
    1
    0.000997
  

  

    278000
    1
    0.000997
  

  

    283000
    1
    0.000997
  

  

    284000
    1
    0.000997
  

  

    291000
    1
    0.000997
  

  

    293000
    1
    0.000997
  

  

    298000
    1
    0.000997
  

  

    302000
    1
    0.000997
  

  

    304000
    1
    0.000997
  

  

    309000
    1
    0.000997
  

  

    313000
    1
    0.000997
  

  

    314000
    1
    0.000997
  

  

    325000
    1
    0.000997
  

  

    326000
    1
    0.000997
  

  

    331000
    1
    0.000997
  

  

    334000
    1
    0.000997
  

  

    337000
    1
    0.000997
  

  

    350000
    1
    0.000997
  

       

     

  		
 





  
CL123 ----> CL273

       image
     
 No. of shared pairs: :30





  
CL123 ----> CL17

       image
     
 No. of shared pairs: :24