Cluster no. 148

Go back to cluster table

Cluster is part of supercluster: 68

Cluster characteristics:

size 9744
size_real 9744
ecount 220632
supercluster 68
annotations_summary
pair_completeness 0.653487188189377
pbs_score None
TR_score None
TR_monomer_length None
loop_index 0.0611008420620251
satellite_probability 1.59500732754148e-18
consensus None
TAREAN_annotation Other
orientation_score 0.9999818764244

protein domains:

No protein domains detected

protein domains:


Reads annotation summary

No similarity hits to repeat databases found

clusters with similarity:

Cluster Number of similarity hits
16 257
22 201
160 15
28 2
171 2
390 2
97 1
126 1
167 1
191 1

clusters connected through mates:

Cluster Number of shared
read pairs
k
22 212 0.058
171 92 0.0497
28 83 0.0346
16 69 0.0198
160 57 0.0308
17 17 0.00255
85 11 0.00476
18 9 0.00323
31 9 0.00152
48 8 0.00192
2690 8 0.00777
6 7 0.00148
47 7 0.00204
721 7 0.00667
45 6 0.00166
9 5 0.0014
14 5 0.00117
23 5 0.00152
63 5 0.00127
130 5 0.00166
2050 5 0.00485
4690 5 0.00487
4 4 0.000919
24 4 0.001
30 4 0.000881
33 4 0.00175
38 4 0.00184
66 4 0.00107
72 4 0.00178
86 4 0.00117
90 4 0.00119
102 4 0.00121
153 4 0.00175
2 3 0.000463
5 3 0.00118
7 3 0.000552
19 3 0.00106
20 3 0.000687
40 3 0.000669
44 3 0.000762
50 3 0.00115
54 3 0.00151
96 3 0.00151
100 3 0.00155
114 3 0.00183
115 3 0.0011
126 3 0.00141
139 3 0.00143
169 3 0.00173
170 3 0.00145
276 3 0.00213
685 3 0.00285
1970 3 0.00292
3310 3 0.00292
4520 3 0.00292
22300 3 0.00293
22400 3 0.00293
23300 3 0.00293
3 2 0.000439
12 2 0.000402
13 2 0.000822
15 2 0.000603
26 2 0.000661
34 2 0.000603
37 2 0.000495
43 2 0.000565
52 2 0.000714
57 2 0.000991
71 2 0.000622
89 2 0.00087
95 2 0.00103
97 2 0.000787
101 2 8e-04
105 2 0.000821
107 2 0.00117
108 2 0.00111
109 2 0.00118
110 2 0.00107
123 2 0.000988
128 2 0.00117
134 2 0.000891
150 2 0.00101
151 2 0.00106
156 2 0.00109
167 2 0.000858
191 2 0.00103
197 2 0.00104
211 2 0.00131
226 2 0.00163
248 2 0.00163
618 2 0.00189
3240 2 0.00194
3970 2 0.00195
5710 2 0.00195
12300 2 0.00195
16300 2 0.00195
20700 2 0.00196
24900 2 0.00195
27800 2 0.00195
27900 2 0.00195
32200 2 0.00196
34000 2 0.00196
48400 2 0.00196
55800 2 0.00196
101000 2 0.00196
101000 2 0.00196
104000 2 0.00196
123000 2 0.00196
132000 2 0.00196
162000 2 0.00196
193000 2 0.00196
205000 2 0.00196
249000 2 0.00196
279000 2 0.00196
284000 2 0.00196
288000 2 0.00196
294000 2 0.00196
306000 2 0.00196
312000 2 0.00196
319000 2 0.00196
320000 2 0.00196
11 1 0.000224
29 1 0.000361
32 1 0.000409
35 1 0.00024
42 1 0.000362
49 1 0.000376
51 1 0.000263
56 1 0.000805
58 1 0.000548
60 1 0.000487
64 1 0.000533
68 1 0.000413
69 1 0.00049
70 1 0.00054
76 1 0.00043
78 1 0.000289
79 1 0.000297
81 1 0.000312
82 1 0.000506
84 1 0.000395
87 1 0.000436
91 1 0.000598
94 1 0.00076
98 1 0.000531
99 1 0.000596
103 1 0.000337
104 1 0.000548
112 1 0.000601
116 1 0.00033
118 1 0.000555
119 1 0.000645
120 1 0.000438
129 1 0.000625
132 1 0.000571
135 1 0.00051
136 1 0.000628
140 1 0.000343
142 1 0.000548
143 1 0.000458
145 1 0.000416
152 1 0.000367
158 1 0.000511
159 1 0.000554
164 1 0.000812
165 1 0.000459
176 1 0.000666
178 1 0.000676
181 1 0.00057
184 1 0.000704
187 1 0.00061
189 1 0.000508
190 1 0.000566
200 1 0.000541
203 1 0.00064
205 1 0.000608
206 1 0.000681
209 1 0.000819
219 1 0.000759
232 1 0.000709
235 1 0.000606
238 1 0.000768
242 1 0.000676
245 1 0.000618
250 1 0.000851
252 1 0.000775
259 1 0.000814
262 1 0.00093
270 1 0.000943
313 1 0.000874
339 1 0.000907
371 1 0.000937
390 1 0.000937
510 1 0.000936
538 1 0.000954
547 1 0.000944
649 1 0.000958
1020 1 0.000974
1130 1 0.000967
1500 1 0.000972
1750 1 0.00097
1780 1 0.000971
1800 1 0.000966
2140 1 0.000969
2440 1 0.000969
4950 1 0.000975
8570 1 0.000976
11800 1 0.000978
11800 1 0.000976
11900 1 0.000978
12000 1 0.000976
12200 1 0.000976
12400 1 0.000977
12400 1 0.000977
13500 1 0.000976
13800 1 0.000977
15900 1 0.000977
16100 1 0.000977
18300 1 0.000978
19500 1 0.000977
20700 1 0.000977
20700 1 0.000978
21300 1 0.000978
21500 1 0.000977
21600 1 0.000978
22600 1 0.000978
22800 1 0.000978
26000 1 0.000978
26600 1 0.000977
28300 1 0.000977
28500 1 0.000978
28700 1 0.000978
30800 1 0.000978
33100 1 0.000978
33100 1 0.000978
37300 1 0.000978
43600 1 0.000978
43900 1 0.000978
48600 1 0.000979
49600 1 0.000978
49600 1 0.000979
49900 1 0.000979
55600 1 0.000978
56500 1 0.000979
56700 1 0.000979
65600 1 0.000979
65600 1 0.000979
65800 1 0.000978
67600 1 0.000978
69100 1 0.000979
69800 1 0.000979
71100 1 0.000978
74100 1 0.000979
74900 1 0.000978
77900 1 0.000978
78100 1 0.000978
80200 1 0.000979
81800 1 0.000979
83000 1 0.000978
84400 1 0.000978
85600 1 0.000978
89800 1 0.000978
95200 1 0.000978
102000 1 0.000978
104000 1 0.000978
112000 1 0.000978
112000 1 0.000978
115000 1 0.000978
131000 1 0.000978
131000 1 0.000978
139000 1 0.000978
142000 1 0.000978
143000 1 0.000978
145000 1 0.000978
145000 1 0.000978
147000 1 0.000978
164000 1 0.000978
167000 1 0.000978
169000 1 0.000978
177000 1 0.000978
189000 1 0.000978
194000 1 0.000978
212000 1 0.000978
213000 1 0.000978
223000 1 0.000978
223000 1 0.000978
231000 1 0.000978
231000 1 0.000978
233000 1 0.000978
236000 1 0.000978
237000 1 0.000978
241000 1 0.000978
242000 1 0.000978
251000 1 0.000978
253000 1 0.000978
260000 1 0.000978
267000 1 0.000978
267000 1 0.000978
269000 1 0.000978
279000 1 0.000978
306000 1 0.000978
307000 1 0.000978
311000 1 0.000978
311000 1 0.000978
322000 1 0.000978
334000 1 0.000978
336000 1 0.000978
340000 1 0.000978
349000 1 0.000978

CL148 ----> CL22

image

No. of shared pairs: :212

CL148 ----> CL171

image

No. of shared pairs: :92

CL148 ----> CL28

image

No. of shared pairs: :83

CL148 ----> CL16

image

No. of shared pairs: :69

CL148 ----> CL160

image

No. of shared pairs: :57

CL148 ----> CL17

image

No. of shared pairs: :17

CL148 ----> CL85

image

No. of shared pairs: :11