size | 9452 |
size_real | 9452 |
ecount | 113292 |
supercluster | 71 |
annotations_summary | 11.27% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-RT 5.42% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-RH 3.41% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-RT 2.61% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-RH 0.88% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-RH 0.78% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-INT 0.71% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-INT 0.66% Class_I/LTR/Ty1_copia/Alesia:Ty1-RT 0.66% Class_I/LTR/Ty1_copia/Gymco-II:Ty1-RT 0.65% Class_I/LTR/Ty1_copia/Tork:Ty1-RT 0.60% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-RT 0.52% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ikeros:Ty1-RT 0.31% organelle/mitochondria 0.30% Class_I/LTR/Ty1_copia/Tork:Ty1-INT 0.20% Class_I/LTR/Ty1_copia/TAR:Ty1-RT 0.12% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-PROT 0.12% Class_I/LTR/Ty1_copia/Gymco-II:Ty1-RH 0.11% Class_I/LTR/Ty1_copia/Tork:Ty1-RH 0.04% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-PROT 0.04% Class_I/LTR/Ty1_copia/Bryco:Ty1-RT 0.04% Class_I/LTR/Ty1_copia/Gymco-I:Ty1-INT 0.03% Class_I/LTR/Ty1_copia/Bryco:Ty1-RH 0.03% Class_I/LTR/Ty1_copia/Alesia:Ty1-RH 0.03% Class_I/LTR/Ty1_copia/Angela:Ty1-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Tork:Ty1-PROT 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Angela:Ty1-RT 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Gymco-I:Ty1-RT 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ty1-outgroup:Ty1-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Alesia:Ty1-INT 0.01% organelle/plastid 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Bryco:Ty1-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ikeros:Ty1-INT |
pair_completeness | 0.689667500893815 |
pbs_score | None |
TR_score | None |
TR_monomer_length | None |
loop_index | 0.0101565806178587 |
satellite_probability | 1.56390811228182e-21 |
consensus | None |
TAREAN_annotation | Other |
orientation_score | 1 |
protein domains:
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|